Al quemarse los combustibles fósiles se producen óxidos de azufre y de nitrógeno, los cuales al combinarse con el agua de las nubes se precipitan en forma de lluvias ácidas, pudiendo arruinar los bosques, eliminar la vida de los lagos y desertificar grandes áreas terrestres.

Los expertos y organizaciones internacionales que se preocupan del medio ambiente, y en especial el PNUMA, la OMS, la OCDE y la OMM, coinciden cada vez más en señalar la necesidad de aplicar en la fuente del consumo de tales combustibles, (por ejemplo, en las centrales térmicas), estrictas medidas de control ambiental, así como establecer una coordinación internacional para evitar que a través del transporte atmosférico no se perjudique a otros países (contaminación transfronteriza). En un futuro cada vez más cercano se quemarán únicamente combustibles fósiles de muy baja acidez.